2006年底，卫生部会同国标委、原建设部、水利部、国土资源部、环保部完成了对1985年版《生活饮用水安全标准》的修订工作，并正式颁布了新版《生活饮用水卫生标准GB 5749-2006》，规定自2012年7月1日起全面实施。修订后的新标准，其中一项最大的变化就是检测指标从35项增加到了106项。其中：
●微生物指标由2项增加至6项
●饮用水消毒剂由1项增至4项
●毒理指标中无机化合物由10项增至21项；毒理指标中有机化合物由5项增至53项
●感官性状和一般化学指标由15项增至20项
●放射性指标中修订了总α放射性
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